Могут ли закрыть ИП если есть долги по налогам?

Да
ИП можно закрыть по желанию самого предпринимателя, и никакая задолженность не помешает. Для этого надо подать заявление в МФЦ
Все долги бывшего ИП остаются. Утрата статуса ИП не отменяет необходимости их выплатить.
Если подавать заявление о закрытии онлайн, госпошлину платить не надо.
Сниматься с учета в СФР и ФФОМС не нужно — это происходит автоматически на основании сведений из ЕГРИП.
Перед закрытием нужно уволить всех работников и отчитаться за них.
После закрытия — сдать остальные отчеты.

Закрытие ИП предоставляется бесплатно в юридическом отделе в МФЦ.